Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms