Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt17Q9QWL7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms