Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms