Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdkl2Q9QUK0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkl2Q9QUK0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms