Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrfQ9JM73 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms