Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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