Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cabp1Q9JLK7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cabp1Q9JLK7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms