Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms