Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms