Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms