Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms