Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms