Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms