Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms