Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms