Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfhx4Q9JJN2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfhx4Q9JJN2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfhx4Q9JJN2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfhx4Q9JJN2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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