Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms