Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms