Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms