Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip2Q9JHR9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip2Q9JHR9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms