Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn12Q9ET43 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms