Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm9sf3Q9ET30 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms