Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rb1cc1Q9ESK9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms