Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aff4Q9ESC8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aff4Q9ESC8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms