Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cse1lQ9ERK4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cse1lQ9ERK4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cse1lQ9ERK4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms