Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtp4Q9ER80 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp4Q9ER80 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms