Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn4aQ9ER60 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scn4aQ9ER60 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn4aQ9ER60 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms