Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx1Q9ER42 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms