Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn1Q9EPL2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms