Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Foxp4Q9DBY0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp4Q9DBY0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms