Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms