Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms