Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TrmuQ9DAT5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms