Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PacrgQ9DAK2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PacrgQ9DAK2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms