Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tmem239Q9DA47 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tmem239Q9DA47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tmem239Q9DA47 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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