Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp12Q9D9M2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp12Q9D9M2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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