Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg7Q9D906 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms