Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc91Q9D8L5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms