Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc52a2Q9D8F3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc52a2Q9D8F3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms