Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms