Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms