Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pus10Q9D3U0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms