Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms