Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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