Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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