Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ift27Q9D0P8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ift27Q9D0P8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift27Q9D0P8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift27Q9D0P8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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