Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms