Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkain1Q9D035 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms