Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Thumpd2Q9CZB3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms