Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srfbp1Q9CZ91 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srfbp1Q9CZ91 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms